Wśród partnerów naukowych Instytutu Archeologii są instytucje zagraniczne i krajowe, np. Römisch-Germanische Kommission des Deutschen Archäologischen Instituts (Frankfurt nad Menem); Museum für Vor- und Frühgeschichte Schloss Charlottenburg/Stiftung Preussischer Kulturbesitz (Berlin); Науково-дослідний центр «Рятівна археологічна служба» Інституту археології Національної академії наук України (Lwów); Freie Universität (Berlin); Eötvös Loránd Tudományegyetem (Budapeszt); Römisch-Germanisches Zentralmuseum (Moguncja); Kulturzentrum Weserrenaissance-Schloss Bevern Niedersachsen; Państwowe Muzeum Archeologiczne w Warszawie; Ośrodek Brama Grodzka-Teatr NN w Lublinie; Muzuem im. ks. St. Staszica w Hrubieszowie.

Efektem intensywnej współpracy były zrealizowane wystawy, konferencje i projekty, np. Tanged Points Cultures in Europe; The turbulent epoch – new materials from the Late Roman Period and the Migration Period; Die Wandalen - die Könige, die Krieger, die Handwerker (Wandalowie – strażnicy bursztynowego szlaku); Illerup Projekt – Illerup Ådal; Das silberne Pferd (Na srebrnym koniu); Troja - sen Henryka Schliemanna; Czerwień - gród między Wschodem a Zachodem; The Younger Generation: erstes Lublin-Berliner Doktorandenkolloqium/pierwsza lubelsko-berlińska konferencja doktorantów; 5th Flint Workshops in Lublin.

Zob. także:
Projekty naukowe